Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Olfr654-201ENSMUST00000098173 1155 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Olfr1154-201ENSMUST00000099844 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm44947-201ENSMUST00000208462 1981 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm4759-201ENSMUST00000183414 6622 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Olfr821-202ENSMUST00000205181 1993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Dcun1d1-212ENSMUST00000198389 3020 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Usp46-201ENSMUST00000068058 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm13484-201ENSMUST00000120738 412 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Scgb2b5-ps-201ENSMUST00000190227 270 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm9989-202ENSMUST00000193125 258 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm44463-201ENSMUST00000198895 137 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm31532-201ENSMUST00000203555 767 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 AC156795.1-201ENSMUST00000214655 414 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 CT009765.2-201ENSMUST00000221331 392 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Cenpk-201ENSMUST00000022227 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 AC114916.1-201ENSMUST00000228465 494 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Zfp781-201ENSMUST00000076281 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm24166-201ENSMUST00000082724 135 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Ighv9-4-201ENSMUST00000103482 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm12789-202ENSMUST00000106915 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm12667-201ENSMUST00000118299 1332 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm11708-201ENSMUST00000119530 832 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm14979-201ENSMUST00000121561 1035 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm23111-201ENSMUST00000122652 105 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm11680-201ENSMUST00000146550 439 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm16321-201ENSMUST00000155184 574 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm23385-201ENSMUST00000158592 295 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm28639-201ENSMUST00000191519 481 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm30524-201ENSMUST00000204271 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm44079-201ENSMUST00000204889 529 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm44686-201ENSMUST00000206776 540 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Hspd1-ps2-201ENSMUST00000210003 1697 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 1700011L03Rik-201ENSMUST00000210613 608 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 4930504O13Rik-201ENSMUST00000064614 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Vmn1r229-201ENSMUST00000076759 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Zfp605-201ENSMUST00000086686 2085 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms