Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 AC160972.1-201ENSMUST00000220971 644 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 CT009765.2-201ENSMUST00000221331 392 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm43594-201ENSMUST00000201153 3442 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm21119-201ENSMUST00000178438 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 A530064N14Rik-201ENSMUST00000195338 1492 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Olfr1438-ps1-201ENSMUST00000208398 4761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm7709-201ENSMUST00000199391 1858 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Sva-202ENSMUST00000117406 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm13902-201ENSMUST00000120168 605 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm14577-201ENSMUST00000121134 256 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm12639-201ENSMUST00000121400 493 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm12730-201ENSMUST00000125277 291 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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Hoxc12Q8K5B8 Gm12609-201ENSMUST00000129908 610 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 4930555B12Rik-201ENSMUST00000135444 283 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm14710-201ENSMUST00000146082 1066 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm24289-201ENSMUST00000157629 135 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm23824-201ENSMUST00000158741 276 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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Hoxc12Q8K5B8 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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Hoxc12Q8K5B8 Gm43214-201ENSMUST00000199242 352 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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Hoxc12Q8K5B8 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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Hoxc12Q8K5B8 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Lcn4-201ENSMUST00000028283 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Cox7b2-201ENSMUST00000050129 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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Hoxc12Q8K5B8 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Olfr1407-ps1-201ENSMUST00000085885 797 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm44822-201ENSMUST00000208559 6389 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Olfr741-202ENSMUST00000205518 3406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Mapk8-203ENSMUST00000111943 1310 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc12Q8K5B8 Btbd35f4-201ENSMUST00000105011 1491 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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