Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm37283-201ENSMUST00000193111 1571 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm24982-201ENSMUST00000104456 132 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm26005-201ENSMUST00000158802 134 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Mir6345-201ENSMUST00000184286 128 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm29232-201ENSMUST00000189100 297 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm43428-201ENSMUST00000200108 3845 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm18011-201ENSMUST00000203717 565 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm30313-201ENSMUST00000216806 597 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 n-R5s160-201ENSMUST00000083096 120 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 AC122317.3-201ENSMUST00000219320 3524 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Olfr646-202ENSMUST00000214099 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm25177-201ENSMUST00000122634 117 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm23098-201ENSMUST00000157552 299 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm29428-201ENSMUST00000190086 409 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm4248-201ENSMUST00000196905 316 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Trim30d-202ENSMUST00000071069 3282 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm24788-201ENSMUST00000104283 156 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Ighv6-5-201ENSMUST00000179796 297 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm44032-201ENSMUST00000204841 166 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Olfr663-201ENSMUST00000209914 959 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 AC156504.1-201ENSMUST00000214608 157 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Rbm41-202ENSMUST00000087400 2229 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gprc6a-203ENSMUST00000219286 2574 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Trim30b-205ENSMUST00000171830 2771 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Olfr1382-202ENSMUST00000213152 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm15916-201ENSMUST00000118355 736 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm25104-201ENSMUST00000122476 163 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm23782-201ENSMUST00000157939 120 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Galntl6-205ENSMUST00000188531 1056 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm28389-201ENSMUST00000190090 697 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm37095-201ENSMUST00000195421 205 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm43853-201ENSMUST00000197162 301 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 2900060B14Rik-201ENSMUST00000203191 616 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 5430402P08Rik-201ENSMUST00000211799 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Olfr1133-202ENSMUST00000217368 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 AC154838.1-201ENSMUST00000228944 911 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Olfr150-202ENSMUST00000217257 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Mrpl1-203ENSMUST00000121477 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Igkv5-45-201ENSMUST00000103366 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 4930404H24Rik-201ENSMUST00000109783 331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm15364-201ENSMUST00000119618 585 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 4930451E10Rik-201ENSMUST00000130840 409 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm24505-201ENSMUST00000157682 126 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm28267-201ENSMUST00000191093 265 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm32772-201ENSMUST00000205898 594 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm40477-202ENSMUST00000221505 881 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 AC131747.1-201ENSMUST00000226159 793 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Kap-201ENSMUST00000048032 707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Olfr685-204ENSMUST00000217432 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Gm7452-202ENSMUST00000202891 3039 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Fat1-206ENSMUST00000215588 13938 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Cyp7a1-201ENSMUST00000029905 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc18Q640L5 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms