Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm7195-201ENSMUST00000190869 1707 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Klhl13-205ENSMUST00000115319 3349 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Vsig4-201ENSMUST00000050707 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm37964-201ENSMUST00000192459 4905 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Olfr826-203ENSMUST00000216661 2858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Pds5b-203ENSMUST00000110486 2900 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Olfr959-202ENSMUST00000215194 4339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Zfp990-201ENSMUST00000105741 3044 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm14305-202ENSMUST00000108981 1646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm42616-201ENSMUST00000198989 4184 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm14878-201ENSMUST00000118167 293 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm12311-201ENSMUST00000118803 374 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm20657-201ENSMUST00000177079 515 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm20830-201ENSMUST00000178016 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm28500-201ENSMUST00000190286 151 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm30043-201ENSMUST00000196689 733 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm42500-201ENSMUST00000199898 517 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm5176-201ENSMUST00000218244 1227 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 9430078K24Rik-202ENSMUST00000219857 348 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 AC154635.1-201ENSMUST00000221433 400 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm9512-201ENSMUST00000223112 497 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 AC154371.1-201ENSMUST00000226600 412 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 C2cd6-201ENSMUST00000097080 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm37195-201ENSMUST00000192006 3018 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 AC113059.2-201ENSMUST00000213462 3016 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Irx1P81068 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Olfr709-ps1-202ENSMUST00000215468 5078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm14015-201ENSMUST00000130634 3949 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Fam46d-204ENSMUST00000167154 3004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 AC131743.1-201ENSMUST00000222138 4024 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm20515-201ENSMUST00000174440 4824 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm15745-201ENSMUST00000119807 115 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Vmn1r-ps132-201ENSMUST00000120434 892 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm17060-201ENSMUST00000172394 824 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm43144-201ENSMUST00000198256 485 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm43408-201ENSMUST00000198263 440 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm31786-202ENSMUST00000212428 676 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Vmn2r-ps92-201ENSMUST00000220242 388 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Tmem69-201ENSMUST00000069674 974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Snord15b-201ENSMUST00000083032 145 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm30524-201ENSMUST00000204271 2300 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Skint3-201ENSMUST00000038455 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm40621-202ENSMUST00000217378 1470 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Olfr728-202ENSMUST00000213685 7087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Cyp7a1-201ENSMUST00000029905 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Irx1P81068 AC144772.3-201ENSMUST00000228829 3126 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Irx1P81068 Elavl4-205ENSMUST00000106600 3799 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms