Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Gm32647-202ENSMUST00000206579 3147 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Oas1e-203ENSMUST00000201172 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Btf3l4-201ENSMUST00000102739 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm11880-201ENSMUST00000117612 399 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm11923-201ENSMUST00000118135 508 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm9443-201ENSMUST00000188406 816 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm17916-203ENSMUST00000189918 324 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Topbp1-ps2-201ENSMUST00000191289 189 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm44002-201ENSMUST00000205134 594 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm44561-201ENSMUST00000208869 264 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 AC120002.1-201ENSMUST00000218456 331 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 AC157570.3-201ENSMUST00000219281 205 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 AC154224.1-201ENSMUST00000224367 403 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm37195-201ENSMUST00000192006 3018 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 AC129085.3-201ENSMUST00000225686 1705 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm11443-201ENSMUST00000118790 479 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm14940-201ENSMUST00000119309 495 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm9378-201ENSMUST00000120315 471 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm24289-201ENSMUST00000157629 135 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm23892-201ENSMUST00000158105 130 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm21232-201ENSMUST00000182187 1006 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm38060-201ENSMUST00000194822 464 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm30043-201ENSMUST00000196689 733 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.3 ms