Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm15128-202ENSMUST00000178833 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Klrc2-204ENSMUST00000119533 717 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm11344-201ENSMUST00000122011 335 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm27579-201ENSMUST00000158113 63 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps70-201ENSMUST00000174636 302 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 1700063H06Rik-201ENSMUST00000183678 445 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm27161-201ENSMUST00000183960 562 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm7858-201ENSMUST00000190177 622 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm29038-201ENSMUST00000191543 678 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Ighv3-7-201ENSMUST00000193370 348 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm44779-201ENSMUST00000206937 708 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 AC134528.1-201ENSMUST00000219156 387 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Olfr427-201ENSMUST00000080831 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 4930522H14Rik-201ENSMUST00000082306 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm20667-201ENSMUST00000175674 1930 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Olfr657-202ENSMUST00000213297 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Olfr183-203ENSMUST00000213465 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm10972-201ENSMUST00000107276 81 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm12787-201ENSMUST00000119234 396 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.2 ms