Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 AC129935.1-201ENSMUST00000226302 873 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Gm26330-201ENSMUST00000082817 104 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Zfp287-201ENSMUST00000005399 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Spata17-202ENSMUST00000110945 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Ssxb9-201ENSMUST00000115584 879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm14304-201ENSMUST00000117272 446 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm16125-201ENSMUST00000159003 339 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm22177-201ENSMUST00000175002 158 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm37193-201ENSMUST00000193087 513 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm36985-201ENSMUST00000195595 379 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm45037-201ENSMUST00000207475 673 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Olfr123-201ENSMUST00000054748 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Vmn1r80-201ENSMUST00000075053 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Olfr570-201ENSMUST00000098215 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gnrhr-203ENSMUST00000113372 2265 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Dlg1-204ENSMUST00000115196 3418 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Acsm3-203ENSMUST00000106527 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Zfp644-203ENSMUST00000112695 1915 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 C430019N01Rik-201ENSMUST00000199517 1567 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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Opn1mwO35599 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 A930017M01Rik-205ENSMUST00000227721 4167 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm37767-201ENSMUST00000193239 1834 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm38307-201ENSMUST00000195630 1840 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Olfr622-202ENSMUST00000213536 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm12131-201ENSMUST00000117479 359 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm12112-201ENSMUST00000117772 231 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm15227-201ENSMUST00000121844 399 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm15338-201ENSMUST00000151884 552 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm27286-201ENSMUST00000184934 179 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm27564-201ENSMUST00000185196 96 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 1700041C23Rik-201ENSMUST00000185243 395 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm37167-201ENSMUST00000194946 396 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm33962-202ENSMUST00000205195 630 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm45209-201ENSMUST00000207122 353 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm45651-201ENSMUST00000210857 335 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Olfr367-ps-203ENSMUST00000213819 541 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms