Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gm28103-201ENSMUST00000188392 416 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm28137-201ENSMUST00000191478 416 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm43015-201ENSMUST00000199087 565 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm42459-201ENSMUST00000199679 742 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 1700065L07Rik-201ENSMUST00000204961 614 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm19761-201ENSMUST00000205372 391 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm45029-201ENSMUST00000208702 391 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm23815-201ENSMUST00000083231 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm23520-201ENSMUST00000093736 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Mrgprb3-201ENSMUST00000094383 1009 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm20667-201ENSMUST00000175674 1930 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Steap2-209ENSMUST00000164219 10089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm36931-201ENSMUST00000192997 4801 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Olfr1052-202ENSMUST00000215090 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm13080-201ENSMUST00000120556 420 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm3835-201ENSMUST00000120752 403 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm13508-201ENSMUST00000121639 775 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm23819-201ENSMUST00000158744 109 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm25598-201ENSMUST00000179031 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Faiml-202ENSMUST00000188555 560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm42926-201ENSMUST00000200496 697 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 AC117949.2-201ENSMUST00000225900 584 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Olfr114-201ENSMUST00000076914 1000 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Glyat-202ENSMUST00000119960 3296 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Serpinb3b-202ENSMUST00000166100 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Zfp969-203ENSMUST00000179061 1458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 AC149294.7-201ENSMUST00000227475 1432 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 AC131720.1-201ENSMUST00000218629 2132 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm2987-201ENSMUST00000187673 1693 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Olfr1043-202ENSMUST00000213886 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm26248-201ENSMUST00000116700 121 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Q1O19441 Gm25778-201ENSMUST00000116713 121 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms