Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm21773-201ENSMUST00000179355 1083 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Gm21921-201ENSMUST00000180040 1083 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Gm43828-201ENSMUST00000196890 639 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Gm45458-201ENSMUST00000209900 522 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Gm8724-201ENSMUST00000081668 483 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Gm24147-201ENSMUST00000082763 144 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Rev3l-207ENSMUST00000164763 10399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Vmn1r52-202ENSMUST00000226520 3125 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Gm37304-201ENSMUST00000193833 2886 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Lipo5-201ENSMUST00000156818 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Gm42614-201ENSMUST00000198724 1554 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Cfap97-206ENSMUST00000164504 4521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Dnah3-201ENSMUST00000046993 12252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Gm14082-201ENSMUST00000118582 801 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Gm14463-201ENSMUST00000121117 498 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Gm22890-201ENSMUST00000158642 144 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Cox6b2-208ENSMUST00000183971 401 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Gm34732-201ENSMUST00000195441 445 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Gm37505-201ENSMUST00000195670 461 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Gm19243-201ENSMUST00000198592 269 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 4932414N04Rik-204ENSMUST00000128259 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Adam26b-201ENSMUST00000080135 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Gm32647-201ENSMUST00000206116 3288 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Olfr735-202ENSMUST00000216634 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Igkv7-33-201ENSMUST00000103376 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Gm20834-201ENSMUST00000179558 684 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 CAAA01216754.6-201ENSMUST00000217183 398 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Lrrc69-201ENSMUST00000023917 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Gm37562-201ENSMUST00000194763 4328 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Olfr1341-202ENSMUST00000214131 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 A730046J19Rik-201ENSMUST00000135687 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 4930467D21Rik-201ENSMUST00000180634 2530 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Olfr113-201ENSMUST00000216181 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Usp9yF8VPU6 Olfr516-203ENSMUST00000217279 1441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm13550-201ENSMUST00000118185 525 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm24751-201ENSMUST00000157844 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm16300-201ENSMUST00000160031 1279 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm17152-201ENSMUST00000172430 535 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm8816-201ENSMUST00000182280 1163 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Olfr879-ps1-201ENSMUST00000212455 694 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 AC121898.1-201ENSMUST00000227599 288 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm6065-201ENSMUST00000081336 492 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Olfr911-ps1-202ENSMUST00000216496 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Igkv14-100-201ENSMUST00000103325 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm15344-201ENSMUST00000152600 421 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Rps11-ps1-201ENSMUST00000171632 475 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm44784-201ENSMUST00000207396 460 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm17737-201ENSMUST00000210183 1147 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm45796-201ENSMUST00000212483 114 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 4930556N09Rik-202ENSMUST00000219466 1015 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 AC155167.1-201ENSMUST00000228931 614 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms