Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Snora64-201ENSMUST00000104521 134 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm25727-201ENSMUST00000104522 131 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm13250-201ENSMUST00000117209 753 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Tmc4-ps-201ENSMUST00000117819 258 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm28514-201ENSMUST00000187488 450 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm29459-201ENSMUST00000191359 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm19418-201ENSMUST00000197436 580 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm17780-201ENSMUST00000207142 612 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 AC127581.1-201ENSMUST00000214084 771 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 4930540M03Rik-201ENSMUST00000216952 437 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm3213-201ENSMUST00000219296 441 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 AC154419.1-201ENSMUST00000227627 272 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm2396-202ENSMUST00000188232 3433 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm38407-202ENSMUST00000219221 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm15189-201ENSMUST00000121164 1966 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Igkv8-19-201ENSMUST00000103389 305 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm15783-201ENSMUST00000117521 633 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm25386-201ENSMUST00000157814 288 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm4045-201ENSMUST00000204076 310 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 CU024892.1-201ENSMUST00000224869 515 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 AC091783.5-201ENSMUST00000224928 671 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Cyld-204ENSMUST00000209206 4032 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Rgs17-202ENSMUST00000064225 8191 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm15926-201ENSMUST00000120492 550 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm12041-201ENSMUST00000121606 602 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm24751-201ENSMUST00000157844 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm42830-201ENSMUST00000196642 313 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm42695-201ENSMUST00000199445 818 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm6065-201ENSMUST00000081336 492 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm43665-201ENSMUST00000198672 1659 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm37749-201ENSMUST00000193917 1899 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Defa-ps15-201ENSMUST00000118178 477 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm24224-201ENSMUST00000158828 258 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm26992-201ENSMUST00000182089 468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 AC113291.1-201ENSMUST00000217557 403 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 AC154738.5-201ENSMUST00000227397 310 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Olfr782-201ENSMUST00000077024 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Olfr364-ps1-201ENSMUST00000104995 1766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Olfr944-203ENSMUST00000215306 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm12805-201ENSMUST00000117305 1048 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm9432-201ENSMUST00000117810 759 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm14562-201ENSMUST00000129885 543 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm23318-201ENSMUST00000158000 108 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps59-201ENSMUST00000174596 135 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm39302-201ENSMUST00000215184 636 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm7099-201ENSMUST00000080066 554 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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