Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm29031-201ENSMUST00000185316 614 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Gm29000-201ENSMUST00000185444 614 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Gm28204-201ENSMUST00000185934 614 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Gm28290-201ENSMUST00000186505 614 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Gm28161-201ENSMUST00000186669 614 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Gm28749-209ENSMUST00000189599 614 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Gm37881-201ENSMUST00000193001 421 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Gm33163-201ENSMUST00000194504 614 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Fbxw15-203ENSMUST00000198397 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Slc31a1-202ENSMUST00000122092 4154 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Olfr410-203ENSMUST00000214490 5075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Slc22a22-201ENSMUST00000022995 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 2610044O15Rik8-205ENSMUST00000190157 1776 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Gm14401-201ENSMUST00000108968 247 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Gm14784-201ENSMUST00000121604 663 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Gm37659-201ENSMUST00000194574 111 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Klra14-ps-202ENSMUST00000203601 1104 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Olfr1496-203ENSMUST00000219412 1067 ntAPPRIS P2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Olfr1496-201ENSMUST00000057390 1067 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Mir132-201ENSMUST00000083603 66 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Olfr1507-203ENSMUST00000206062 2803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Gm43844-201ENSMUST00000202926 5605 ntBASIC7.34□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm37696-201ENSMUST00000194223 3349 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm26535-201ENSMUST00000181602 2600 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm7173-201ENSMUST00000101410 2832 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm13195-201ENSMUST00000117229 261 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Tmc4-ps-201ENSMUST00000117819 258 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm12340-201ENSMUST00000121617 462 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm15962-201ENSMUST00000124184 750 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm13905-201ENSMUST00000140009 579 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm43001-202ENSMUST00000199076 192 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm44485-201ENSMUST00000199569 137 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Resp18-201ENSMUST00000039534 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Vmn1r215-201ENSMUST00000072972 1048 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Olfr1253-201ENSMUST00000099765 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Rapgef4-201ENSMUST00000028525 4109 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm38106-201ENSMUST00000194107 2534 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm15226-201ENSMUST00000156526 2971 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm10933-201ENSMUST00000221891 1861 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Snhg14-201ENSMUST00000185272 726 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Scgb2b6-201ENSMUST00000188132 330 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Olfr664-201ENSMUST00000072887 966 ntAPPRIS P5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm2888-201ENSMUST00000170521 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm31258-201ENSMUST00000194532 3297 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm5155-201ENSMUST00000072381 2841 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Stk31-202ENSMUST00000163954 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Pign-201ENSMUST00000070699 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm5885-202ENSMUST00000203357 528 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Klk1b18-ps-201ENSMUST00000205780 167 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Olfr782-201ENSMUST00000077024 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc18Q640L5 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms