Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 4930503L19Rik-202ENSMUST00000211817 913 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 AC160863.2-201ENSMUST00000218392 858 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 AC163646.1-201ENSMUST00000227704 397 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Gm25418-201ENSMUST00000104214 129 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Ccnb2-ps-201ENSMUST00000118290 623 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Gm7421-201ENSMUST00000119298 639 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Gm7365-201ENSMUST00000120877 639 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Defa-ps12-201ENSMUST00000122353 193 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Gm5924-201ENSMUST00000132554 871 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Xaf1-202ENSMUST00000140842 651 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Gm2892-201ENSMUST00000145537 711 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Gm17542-201ENSMUST00000169859 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Gm5926-201ENSMUST00000177740 711 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Spin2e-201ENSMUST00000179716 705 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Mrgprb13-201ENSMUST00000188191 985 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 1700074A21Rik-201ENSMUST00000192404 346 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Gm43556-201ENSMUST00000196186 681 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Arl8b-202ENSMUST00000204483 695 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 AC153553.1-201ENSMUST00000218257 684 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 AC124569.4-201ENSMUST00000223830 1220 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 AC113031.2-201ENSMUST00000226132 579 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 CT030662.1-201ENSMUST00000227380 232 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Olfr1052-201ENSMUST00000054746 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Hsfy2-201ENSMUST00000062085 1392 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Puf60Q3UEB3 Olfr364-ps1-201ENSMUST00000104995 1766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Gm2888-201ENSMUST00000170521 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Gm7876-202ENSMUST00000171305 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Eif1-ps3-201ENSMUST00000121450 342 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Gm22312-201ENSMUST00000158005 130 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Gm22646-201ENSMUST00000175130 115 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Obox4-ps15-201ENSMUST00000178057 1140 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Obox4-ps19-201ENSMUST00000178284 1140 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Obox4-ps20-201ENSMUST00000179591 1140 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Obox4-ps21-201ENSMUST00000179856 1140 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Gm29259-201ENSMUST00000186396 694 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 4930447N08Rik-201ENSMUST00000196290 497 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Igkv13-57-2-201ENSMUST00000196590 336 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Gm7946-201ENSMUST00000203326 958 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Gm44646-201ENSMUST00000205847 421 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Olfr187-201ENSMUST00000206428 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 1700011L03Rik-201ENSMUST00000210613 608 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Puf60Q3UEB3 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms