Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 AL807824.1-201ENSMUST00000223151 183 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 AC113031.3-201ENSMUST00000226552 190 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Olfr1112-201ENSMUST00000053050 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Vmn1r215-201ENSMUST00000072972 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm37652-201ENSMUST00000195290 2095 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Vav3-202ENSMUST00000106576 3123 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Olfr620-201ENSMUST00000052152 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm19666-201ENSMUST00000198176 1893 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Nxf3-201ENSMUST00000080929 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Olfr1458-202ENSMUST00000215160 1914 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Ifi203-203ENSMUST00000123708 3482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Fus-202ENSMUST00000079045 2623 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Klhl13-201ENSMUST00000035973 2996 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm44424-201ENSMUST00000203438 1826 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm29293-201ENSMUST00000189416 2188 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Olfr653-202ENSMUST00000215585 4765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Olfr653-203ENSMUST00000217466 4786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm23746-201ENSMUST00000104229 125 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm13484-201ENSMUST00000120738 412 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm6565-201ENSMUST00000121217 438 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm15962-201ENSMUST00000124184 750 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm23959-201ENSMUST00000157208 324 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm37708-201ENSMUST00000192337 895 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm43295-201ENSMUST00000201439 412 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Olfr1455-ps1-201ENSMUST00000208608 771 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm45639-201ENSMUST00000211205 710 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 AC158803.2-201ENSMUST00000219452 679 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Ccl5-201ENSMUST00000035938 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Resp18-201ENSMUST00000039534 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Olfr202-201ENSMUST00000049859 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm6361-201ENSMUST00000091031 435 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Ube2v2-201ENSMUST00000096234 609 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm7646-201ENSMUST00000198590 1346 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 AC162938.2-205ENSMUST00000217551 2828 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Olfr1115-204ENSMUST00000217196 2109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm38032-201ENSMUST00000195052 1589 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Olfr685-204ENSMUST00000217432 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Apool-202ENSMUST00000113415 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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Sh3bp1P55194 Gm13687-201ENSMUST00000119857 282 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm15428-201ENSMUST00000121352 333 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm22958-201ENSMUST00000122512 184 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Rgs2-204ENSMUST00000153527 588 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps148-201ENSMUST00000176775 455 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Mrgpra14-201ENSMUST00000189782 913 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Fbxw27-201ENSMUST00000197125 810 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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