Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
P10404 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
P10404 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
P10404 Zfp955a-201ENSMUST00000008830 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
P10404 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Olfr448-203ENSMUST00000214529 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Olfr1026-202ENSMUST00000217615 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Gm14909-201ENSMUST00000117853 351 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Sval2-201ENSMUST00000014248 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Gm37803-201ENSMUST00000191620 711 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Gm37062-201ENSMUST00000195028 701 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Gm43617-201ENSMUST00000196418 606 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Gm43114-201ENSMUST00000198298 343 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Gm6719-201ENSMUST00000202067 335 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 AC133101.1-201ENSMUST00000226939 1199 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P10404 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
P10404 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
P10404 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
P10404 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
P10404 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
P10404 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
P10404 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
P10404 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
P10404 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
P10404 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
P10404 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
P10404 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
P10404 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
P10404 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
P10404 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
P10404 Bpifc-202ENSMUST00000105304 451 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
P10404 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
P10404 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms