Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm45392-201ENSMUST00000210441 214 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 AC156639.1-201ENSMUST00000216503 660 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 AC112142.1-206ENSMUST00000228136 982 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Fabp9-201ENSMUST00000029038 583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Olfr904-201ENSMUST00000058153 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Olfr768-201ENSMUST00000063031 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Olfr1503-ps1-201ENSMUST00000076614 803 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm8724-201ENSMUST00000081668 483 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Olfr593-201ENSMUST00000098206 984 ntAPPRIS P2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Olfr364-ps1-201ENSMUST00000104995 1766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 A530099J19Rik-201ENSMUST00000151029 2764 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm16421-201ENSMUST00000117616 1557 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm42551-201ENSMUST00000197701 1573 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Vmn2r-ps42-201ENSMUST00000174123 2083 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Olfr715b-202ENSMUST00000215713 3879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Neb-202ENSMUST00000036934 22489 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Dnah7a-201ENSMUST00000094964 12245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm42680-201ENSMUST00000196238 2500 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Nfatc3-202ENSMUST00000211991 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 1700097M23Rik-201ENSMUST00000204079 1522 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Cd226-201ENSMUST00000037142 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm43845-201ENSMUST00000202462 1820 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm1968-201ENSMUST00000100016 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm12401-201ENSMUST00000118435 228 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm15553-201ENSMUST00000118757 430 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Chrna1os-201ENSMUST00000125413 680 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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Ccl20O89093 Gm22243-201ENSMUST00000178754 120 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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Ccl20O89093 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm36986-201ENSMUST00000195320 353 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Olfr747-202ENSMUST00000205373 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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Ccl20O89093 Gm7588-201ENSMUST00000216866 571 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm23510-201ENSMUST00000083083 163 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 C2cd6-201ENSMUST00000097080 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Olfr1138-201ENSMUST00000099848 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Olfr1258-203ENSMUST00000213720 7098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Olfr270-203ENSMUST00000215010 2502 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm37747-201ENSMUST00000193717 4003 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 3110080E11Rik-201ENSMUST00000210736 3477 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gprc6a-201ENSMUST00000020062 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Olfr247-202ENSMUST00000215871 1983 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Elf1-202ENSMUST00000110835 3888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm281-201ENSMUST00000144914 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Olfr2-203ENSMUST00000208147 6178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm37195-201ENSMUST00000192006 3018 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 AC154313.1-201ENSMUST00000217755 3841 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Fgf7-202ENSMUST00000110442 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Olfr1353-203ENSMUST00000205193 1924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm44567-201ENSMUST00000205645 2631 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm44624-201ENSMUST00000208700 2278 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm23594-201ENSMUST00000104307 134 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Xlr5d-ps-201ENSMUST00000117501 782 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm12734-201ENSMUST00000120228 948 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm6062-201ENSMUST00000120462 631 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm15212-201ENSMUST00000122403 466 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.9 ms