Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Olfr890-202ENSMUST00000213458 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps11-201ENSMUST00000176568 2730 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Pnpla8-204ENSMUST00000143771 2974 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Olfr1341-202ENSMUST00000214131 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm37696-201ENSMUST00000194223 3349 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Tcrg-C2-201ENSMUST00000103561 914 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm14221-201ENSMUST00000109473 340 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm12988-201ENSMUST00000119054 478 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Tex35-204ENSMUST00000121911 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm25103-201ENSMUST00000122671 318 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm14288-202ENSMUST00000123863 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm15762-201ENSMUST00000126447 333 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm11844-201ENSMUST00000129207 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps62-201ENSMUST00000173275 910 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm20711-201ENSMUST00000177351 714 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 C4bp-ps1-201ENSMUST00000189393 706 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm42625-201ENSMUST00000198611 922 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 AC153801.1-201ENSMUST00000217904 947 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm8288-201ENSMUST00000223406 593 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Pate2-202ENSMUST00000118254 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Olfr620-201ENSMUST00000052152 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Olfr1480-202ENSMUST00000207093 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm43130-201ENSMUST00000197721 3907 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm3020-201ENSMUST00000112801 450 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Rpl38-ps2-201ENSMUST00000117356 213 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Eif3s6-ps1-201ENSMUST00000117907 470 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm8129-201ENSMUST00000118230 213 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm14861-201ENSMUST00000119451 455 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm16321-201ENSMUST00000155184 574 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm17191-201ENSMUST00000165200 417 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm28129-201ENSMUST00000186273 537 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm33093-201ENSMUST00000197751 790 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm44259-201ENSMUST00000204996 298 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Olfr1311-201ENSMUST00000208536 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Rps26-ps1-202ENSMUST00000212102 351 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Dnah12-202ENSMUST00000073309 611 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Vmn1r52-201ENSMUST00000079832 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Olfr1406-203ENSMUST00000215878 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Stard9-207ENSMUST00000180041 15102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Zfp969-203ENSMUST00000179061 1458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Vmn2r83-201ENSMUST00000167976 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Slfn10-ps-201ENSMUST00000100716 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms