Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29325-201ENSMUST00000190705 2528 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ino80d-205ENSMUST00000165066 13529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr920-201ENSMUST00000074740 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC153964.1-201ENSMUST00000219677 3142 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23709-201ENSMUST00000104364 130 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12852-201ENSMUST00000119478 719 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14369-201ENSMUST00000121355 285 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14697-201ENSMUST00000147144 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stk31-204ENSMUST00000172459 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl31-ps24-201ENSMUST00000181350 379 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28304-201ENSMUST00000185977 312 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Skint2-204ENSMUST00000186969 1258 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29256-201ENSMUST00000189094 312 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28484-201ENSMUST00000190606 312 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37636-201ENSMUST00000193583 359 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38991-201ENSMUST00000205504 138 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm35325-201ENSMUST00000208979 771 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45499-201ENSMUST00000211656 280 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2210414F02Rik-201ENSMUST00000215316 396 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7093-201ENSMUST00000223004 581 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 3830408C21Rik-203ENSMUST00000224293 822 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 U90926-201ENSMUST00000031356 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam183b-201ENSMUST00000060581 493 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25140-201ENSMUST00000083254 140 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr410-203ENSMUST00000214490 5075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1226-203ENSMUST00000215562 2669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd86-201ENSMUST00000089620 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr470-203ENSMUST00000220193 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC113059.3-201ENSMUST00000217423 2777 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37143-201ENSMUST00000195180 3259 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23746-201ENSMUST00000104229 125 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam107b-205ENSMUST00000115055 515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13501-201ENSMUST00000118477 979 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11631-201ENSMUST00000119220 156 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15350-201ENSMUST00000135138 569 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930517O19Rik-202ENSMUST00000145018 571 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv5-8-201ENSMUST00000166255 278 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snrpe-203ENSMUST00000166291 360 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11394-201ENSMUST00000181421 517 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scgb2b12-201ENSMUST00000183195 511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9443-201ENSMUST00000188406 816 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37134-201ENSMUST00000195810 628 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42500-201ENSMUST00000199898 517 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44145-201ENSMUST00000203711 172 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45523-201ENSMUST00000210712 799 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Calml4-203ENSMUST00000213643 710 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC118230.1-201ENSMUST00000220196 656 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CR974429.1-201ENSMUST00000220877 827 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC165092.2-201ENSMUST00000224681 368 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr202-201ENSMUST00000049859 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms