Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 1110060G06Rik-201ENSMUST00000200372 499 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Tas2r118-201ENSMUST00000062463 900 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Vmn1r236-201ENSMUST00000066998 1121 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Ube2u-202ENSMUST00000133493 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm43376-202ENSMUST00000199747 1743 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm24835-201ENSMUST00000116777 111 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm22091-201ENSMUST00000116908 127 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm7974-201ENSMUST00000117154 408 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm12873-201ENSMUST00000119988 422 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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RpainQ9CWY9 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 AC145736.1-201ENSMUST00000214661 479 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Olfr1073-ps1-202ENSMUST00000215705 478 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 AC124399.1-201ENSMUST00000218334 590 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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RpainQ9CWY9 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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RpainQ9CWY9 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Ugt2b5-201ENSMUST00000067790 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm26717-201ENSMUST00000181713 1418 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Olfr457-203ENSMUST00000204324 4275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Fat1-201ENSMUST00000098796 14627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm7739-201ENSMUST00000221131 1560 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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