Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm14135-201ENSMUST00000135438 591 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm26490-201ENSMUST00000157879 140 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 0610040B10Rik-201ENSMUST00000160231 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm17377-201ENSMUST00000165184 207 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Mir1264-201ENSMUST00000175381 86 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Vmn1r-ps20-201ENSMUST00000176809 915 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm24925-201ENSMUST00000178157 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm27845-201ENSMUST00000184479 114 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm9541-201ENSMUST00000188409 502 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm44300-201ENSMUST00000196792 121 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm43428-201ENSMUST00000200108 3845 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm5885-202ENSMUST00000203357 528 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm32453-201ENSMUST00000204183 456 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm45240-201ENSMUST00000211437 674 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Fcf1-201ENSMUST00000021669 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 AC166323.1-201ENSMUST00000217756 367 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 AC167192.1-201ENSMUST00000225908 139 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Il1f8-201ENSMUST00000028363 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Cox7b2-201ENSMUST00000050129 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Olfr957-201ENSMUST00000051653 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm14393-201ENSMUST00000072895 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 AC153494.1-201ENSMUST00000218664 3041 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Btbd35f4-201ENSMUST00000105011 1491 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Olfr1300-ps1-201ENSMUST00000208175 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Igkv10-94-201ENSMUST00000103330 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm11965-201ENSMUST00000122017 277 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm22214-201ENSMUST00000157563 172 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm5777-201ENSMUST00000177265 448 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm10717-206ENSMUST00000177875 675 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Mir7012-201ENSMUST00000183900 64 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm19066-201ENSMUST00000193232 1078 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm44138-201ENSMUST00000204939 271 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Olfr192-202ENSMUST00000205727 1141 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm9973-202ENSMUST00000220926 166 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 AC154552.5-201ENSMUST00000222352 207 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 C2cd6b-201ENSMUST00000054653 878 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Olfr971-201ENSMUST00000075467 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm22578-201ENSMUST00000083730 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm22444-201ENSMUST00000093693 108 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms