Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm22895-201ENSMUST00000157508 308 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm17023-201ENSMUST00000165885 448 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Esp38-201ENSMUST00000178880 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 4933440J02Rik-201ENSMUST00000181547 1144 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 1700101O22Rik-201ENSMUST00000187396 339 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm38080-201ENSMUST00000194035 268 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 1700063I16Rik-201ENSMUST00000194611 611 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm5-202ENSMUST00000202386 420 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm43888-201ENSMUST00000204405 2587 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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Sh3bp1P55194 Olfr644-202ENSMUST00000213184 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Abi3bp-202ENSMUST00000096012 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Ino80d-205ENSMUST00000165066 13529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Primpol-201ENSMUST00000040468 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 B230206I08Rik-201ENSMUST00000207479 3191 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm14621-201ENSMUST00000117709 689 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm29513-201ENSMUST00000185741 202 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm21856-201ENSMUST00000187547 696 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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Sh3bp1P55194 Gm18547-201ENSMUST00000192439 811 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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Sh3bp1P55194 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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Sh3bp1P55194 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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Sh3bp1P55194 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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Sh3bp1P55194 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Olfr235-202ENSMUST00000207969 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Olfr821-202ENSMUST00000205181 1993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Pik3c2g-209ENSMUST00000187618 2023 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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Sh3bp1P55194 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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Sh3bp1P55194 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm11983-202ENSMUST00000184940 318 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm29527-201ENSMUST00000190722 622 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm44516-201ENSMUST00000208794 833 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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