Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm39302-201ENSMUST00000215184 636 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 AC069561.3-201ENSMUST00000217321 114 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm24144-201ENSMUST00000082632 111 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm45577-201ENSMUST00000210206 2287 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm44689-201ENSMUST00000208786 1372 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm2768-201ENSMUST00000121062 250 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm14980-201ENSMUST00000121247 736 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm15533-201ENSMUST00000126205 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Pagr1a-201ENSMUST00000162069 422 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Klra5-204ENSMUST00000169901 792 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Obox3-ps5-201ENSMUST00000176412 1003 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Clec5a-204ENSMUST00000177178 665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm23864-201ENSMUST00000177607 107 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm17956-201ENSMUST00000199931 838 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Olfr1556-ps1-201ENSMUST00000204688 466 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm18696-201ENSMUST00000220103 274 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 AC124433.2-201ENSMUST00000223867 291 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Olfr633-201ENSMUST00000098188 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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