Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Vmn2r110-201ENSMUST00000169559 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Pbrm1-201ENSMUST00000022471 5871 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm33378-201ENSMUST00000219831 2758 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Sult6b1-204ENSMUST00000169544 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Zfp605-201ENSMUST00000086686 2085 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm4922-201ENSMUST00000055107 1950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm14383-201ENSMUST00000121637 386 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Vmn2r-ps59-201ENSMUST00000174596 135 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Cox6b2-206ENSMUST00000182738 423 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Apoo-ps-201ENSMUST00000061241 586 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Olfr944-201ENSMUST00000079650 936 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Usp9x-201ENSMUST00000089302 11887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm43376-202ENSMUST00000199747 1743 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Vmn1r58-201ENSMUST00000108569 10140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Tug1-202ENSMUST00000144852 4720 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm44820-201ENSMUST00000207420 396 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 CR974429.1-201ENSMUST00000220877 827 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 AC122357.2-201ENSMUST00000220732 1525 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Enam-202ENSMUST00000199104 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Kcnrg-201ENSMUST00000051184 1766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm14621-201ENSMUST00000117709 689 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Nell1os-203ENSMUST00000152166 410 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm10292-201ENSMUST00000183142 581 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm4928-201ENSMUST00000219622 850 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 AC137871.2-201ENSMUST00000226482 289 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Dnase2b-201ENSMUST00000029836 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Olfr799-203ENSMUST00000214182 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Ifit2-201ENSMUST00000102826 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 CAAA01194877.1-201ENSMUST00000213137 4233 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm19666-201ENSMUST00000198176 1893 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Olfr134-202ENSMUST00000215900 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Btbd35f7-201ENSMUST00000105007 1960 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Rps24-205ENSMUST00000223999 525 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sptan1P16546 Ly6a-201ENSMUST00000023248 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms