Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm37021-201ENSMUST00000195835 663 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 AC134864.1-201ENSMUST00000226326 511 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Olfr135-201ENSMUST00000076245 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Olfr833-ps1-201ENSMUST00000086493 913 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Amy1-201ENSMUST00000067980 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Zfhx4-205ENSMUST00000176383 13500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Mmp1a-201ENSMUST00000034492 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Gm21850-201ENSMUST00000179792 359 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Gm27690-201ENSMUST00000184596 126 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Mir6975-201ENSMUST00000184879 61 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Gm45034-201ENSMUST00000206831 482 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Prl2c1-201ENSMUST00000054932 681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Krtap31-2-201ENSMUST00000058761 935 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Olfr881-201ENSMUST00000074611 948 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Rpl21-ps4-201ENSMUST00000080237 438 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Gm22444-201ENSMUST00000093693 108 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Vav3-202ENSMUST00000106576 3123 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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Opn1mwO35599 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Gm2987-201ENSMUST00000187673 1693 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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Opn1mwO35599 Plgrkt-201ENSMUST00000016639 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Gm5372-201ENSMUST00000187540 409 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Gm28396-201ENSMUST00000190309 379 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 2610012C04Rik-201ENSMUST00000193434 1023 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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Opn1mwO35599 Gm42982-201ENSMUST00000198574 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Gm40323-201ENSMUST00000200649 645 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Gm46327-201ENSMUST00000218240 365 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Gm16381-201ENSMUST00000220528 503 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Gm2001-201ENSMUST00000223236 503 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 AC107369.1-201ENSMUST00000227373 860 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Opn1mwO35599 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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