Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MttpO08601 Gm2004-201ENSMUST00000109049 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MttpO08601 Gm14419-202ENSMUST00000126358 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MttpO08601 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MttpO08601 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MttpO08601 C130073E24Rik-202ENSMUST00000211313 14112 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MttpO08601 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MttpO08601 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MttpO08601 Fgf7-201ENSMUST00000064794 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MttpO08601 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MttpO08601 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MttpO08601 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MttpO08601 AI481877-201ENSMUST00000107547 4664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MttpO08601 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MttpO08601 Gpr21-201ENSMUST00000065441 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MttpO08601 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MttpO08601 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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MttpO08601 Tcrg-C2-201ENSMUST00000103561 914 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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MttpO08601 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MttpO08601 Gm8202-201ENSMUST00000117682 310 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MttpO08601 Gm11433-201ENSMUST00000118318 228 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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MttpO08601 Gm14861-201ENSMUST00000119451 455 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MttpO08601 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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MttpO08601 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MttpO08601 Gm14011-201ENSMUST00000145178 302 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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MttpO08601 Gm6673-201ENSMUST00000166114 700 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MttpO08601 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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MttpO08601 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MttpO08601 Faiml-202ENSMUST00000188555 560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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MttpO08601 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MttpO08601 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MttpO08601 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MttpO08601 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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MttpO08601 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MttpO08601 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MttpO08601 AC122508.1-201ENSMUST00000218365 233 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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MttpO08601 Egfros-201ENSMUST00000150329 4063 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MttpO08601 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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MttpO08601 Zfp950-204ENSMUST00000143264 4825 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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MttpO08601 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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MttpO08601 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MttpO08601 Ino80d-205ENSMUST00000165066 13529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MttpO08601 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MttpO08601 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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MttpO08601 Fcrl5-201ENSMUST00000049926 1791 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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MttpO08601 Tex35-204ENSMUST00000121911 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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MttpO08601 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MttpO08601 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MttpO08601 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
MttpO08601 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MttpO08601 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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MttpO08601 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MttpO08601 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MttpO08601 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MttpO08601 Olfr2-203ENSMUST00000208147 6178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MttpO08601 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
MttpO08601 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
MttpO08601 Olfr884-202ENSMUST00000181088 3185 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MttpO08601 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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