Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm14393-202ENSMUST00000109066 564 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm12112-201ENSMUST00000117772 231 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 1700031A10Rik-201ENSMUST00000174380 656 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 1700013M08Rik-201ENSMUST00000197709 683 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm44232-201ENSMUST00000204537 225 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm8911-201ENSMUST00000213986 652 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 AC156832.3-201ENSMUST00000215591 435 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 CT025617.1-201ENSMUST00000216487 725 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 AL589742.1-201ENSMUST00000226034 349 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm6177-201ENSMUST00000085589 465 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Fbxw14-203ENSMUST00000198844 1786 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Olfr685-204ENSMUST00000217432 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Nfatc3-202ENSMUST00000211991 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 AC162938.2-205ENSMUST00000217551 2828 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm37504-201ENSMUST00000192537 2374 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm40621-202ENSMUST00000217378 1470 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Klri2-201ENSMUST00000050385 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Olfr620-201ENSMUST00000052152 3157 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm3055-201ENSMUST00000105316 720 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm11633-201ENSMUST00000118176 444 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm13220-201ENSMUST00000121535 508 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Crem-219ENSMUST00000140332 1015 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Sox5os5-201ENSMUST00000152192 207 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm23465-201ENSMUST00000157134 262 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Mir1947-201ENSMUST00000158235 85 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm15796-201ENSMUST00000162135 204 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Vmn1r139-202ENSMUST00000173668 753 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Vmn2r-ps64-201ENSMUST00000173690 523 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm26992-201ENSMUST00000182089 468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Mir6963-201ENSMUST00000183535 71 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Snhg14-201ENSMUST00000185272 726 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm4557-201ENSMUST00000185826 907 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm4526-201ENSMUST00000186039 920 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm8708-201ENSMUST00000188500 906 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm38221-201ENSMUST00000195146 365 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm33626-201ENSMUST00000206790 828 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Olfr574-202ENSMUST00000211329 1039 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 AC122508.1-201ENSMUST00000218365 233 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Mup14-201ENSMUST00000071005 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Zfp781-201ENSMUST00000076281 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Olfr1505-201ENSMUST00000081520 1103 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Olfr1459-202ENSMUST00000213493 8854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Usp46-201ENSMUST00000068058 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Il1rapl1-203ENSMUST00000113966 9133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm43654-201ENSMUST00000200664 3417 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Entpd1-201ENSMUST00000112231 4221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Olfr410-203ENSMUST00000214490 5075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 1700017N19Rik-210ENSMUST00000218464 1597 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Fam135a-206ENSMUST00000187369 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm11914-201ENSMUST00000117094 507 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm15333-201ENSMUST00000118825 364 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm15012-201ENSMUST00000119176 106 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms