Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Hba-ps4-201ENSMUST00000128900 447 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Magea9-ps-201ENSMUST00000140655 732 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Gm25520-201ENSMUST00000158389 118 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Magea9-ps-202ENSMUST00000167328 899 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Olfr306-ps1-201ENSMUST00000174677 743 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Gm31693-201ENSMUST00000200150 909 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Gm45016-201ENSMUST00000208375 396 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Gm2516-201ENSMUST00000210011 954 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Gm34113-201ENSMUST00000213796 388 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 AC166358.4-201ENSMUST00000223030 105 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r36-202ENSMUST00000226635 918 ntAPPRIS P2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 AC154618.1-201ENSMUST00000227451 303 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 AC155922.2-201ENSMUST00000220240 1458 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Olfr134-202ENSMUST00000215900 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r13-202ENSMUST00000226892 5156 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Serpinb3c-201ENSMUST00000027565 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Gm773-201ENSMUST00000101561 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Gm11843-201ENSMUST00000118984 425 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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Sgo1Q9CXH7 Gm13902-201ENSMUST00000120168 605 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Cyp4a29-ps1-201ENSMUST00000120882 171 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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Sgo1Q9CXH7 Gm13180-201ENSMUST00000141222 440 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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Sgo1Q9CXH7 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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Sgo1Q9CXH7 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Gm26683-201ENSMUST00000181737 470 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Gm32391-201ENSMUST00000191839 540 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Gm37473-201ENSMUST00000195079 674 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Gm37900-201ENSMUST00000195510 3805 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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