Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm27659-201ENSMUST00000183472 98 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm28935-201ENSMUST00000185737 568 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm29263-201ENSMUST00000188718 463 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm18775-201ENSMUST00000190763 586 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm37098-201ENSMUST00000192290 244 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm45658-201ENSMUST00000209197 580 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 AC105407.3-201ENSMUST00000224161 648 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 AC124549.1-201ENSMUST00000225912 333 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Olfr1454-201ENSMUST00000073732 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Olfr1221-201ENSMUST00000099795 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm29293-201ENSMUST00000189416 2188 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Olfr1224-ps1-204ENSMUST00000216833 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Olfr1052-202ENSMUST00000215090 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm14360-201ENSMUST00000120670 393 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm11404-201ENSMUST00000120872 494 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Serpina3l-ps-201ENSMUST00000163975 1264 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Mir7056-201ENSMUST00000183776 59 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Mir7012-201ENSMUST00000183900 64 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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Hoxd13P70217 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 AC164424.1-201ENSMUST00000221690 170 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 AC121960.3-201ENSMUST00000227077 623 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Olfr826-202ENSMUST00000203720 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms