Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtpreP49446 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtpreP49446 Gm28974-201ENSMUST00000187893 231 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PtpreP49446 Gm29038-201ENSMUST00000191543 678 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PtpreP49446 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PtpreP49446 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PtpreP49446 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PtpreP49446 Gm44858-201ENSMUST00000207360 154 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PtpreP49446 Gm34158-201ENSMUST00000216390 567 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtpreP49446 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtpreP49446 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtpreP49446 AC119241.1-201ENSMUST00000223651 534 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PtpreP49446 Gm22169-201ENSMUST00000083229 107 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PtpreP49446 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtpreP49446 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtpreP49446 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtpreP49446 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtpreP49446 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtpreP49446 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtpreP49446 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PtpreP49446 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
PtpreP49446 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
PtpreP49446 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
PtpreP49446 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm14736-201ENSMUST00000121470 336 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm13470-201ENSMUST00000123911 421 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm24584-201ENSMUST00000157972 107 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm27579-201ENSMUST00000158113 63 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm3470-201ENSMUST00000160819 420 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm8247-202ENSMUST00000178759 375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm22286-201ENSMUST00000179708 107 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm23648-201ENSMUST00000180301 107 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Ikzf2-209ENSMUST00000191262 1146 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm42522-201ENSMUST00000196071 255 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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PtpreP49446 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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PtpreP49446 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm23506-201ENSMUST00000083077 107 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm24535-201ENSMUST00000083140 107 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm22352-201ENSMUST00000083917 107 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm7195-201ENSMUST00000190869 1707 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm25879-201ENSMUST00000104330 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Rpl26-ps5-201ENSMUST00000122220 439 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm25784-201ENSMUST00000122524 81 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpreP49446 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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