Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm24897-201ENSMUST00000179033 107 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm8532-201ENSMUST00000179174 461 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Scgb2b21-201ENSMUST00000185407 520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm18342-201ENSMUST00000186987 694 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm18505-201ENSMUST00000187360 790 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm2427-201ENSMUST00000189121 881 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 AL513022.1-201ENSMUST00000220489 504 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 5430402E10Rik-201ENSMUST00000063127 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Olfr919-201ENSMUST00000071425 948 ntAPPRIS P2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Olfr934-202ENSMUST00000214324 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm29219-201ENSMUST00000187224 1499 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm29616-201ENSMUST00000188777 1499 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm5346-201ENSMUST00000056023 2326 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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Hoxd9P28357 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm14761-201ENSMUST00000121363 262 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm12693-201ENSMUST00000121965 483 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Snrpe-203ENSMUST00000166291 360 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm22851-201ENSMUST00000178741 94 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm25873-201ENSMUST00000180317 107 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm8816-201ENSMUST00000182280 1163 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Scgb2b6-201ENSMUST00000188132 330 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm42832-201ENSMUST00000196361 745 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm6719-201ENSMUST00000202067 335 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
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