Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 A530083M17Rik-201ENSMUST00000199877 3376 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Gm8145-201ENSMUST00000118220 745 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Gm11346-201ENSMUST00000118346 704 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Gm14554-201ENSMUST00000119548 661 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Gm26487-201ENSMUST00000158022 94 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 0610040B10Rik-201ENSMUST00000160231 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Plgrkt-201ENSMUST00000016639 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Vmn1r-ps77-201ENSMUST00000174184 921 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Vmn1r-ps75-201ENSMUST00000174316 920 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Gm16456-201ENSMUST00000174431 920 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Gm28967-201ENSMUST00000187351 281 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Gm37659-201ENSMUST00000194574 111 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Gm45247-201ENSMUST00000210757 309 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Gm45435-201ENSMUST00000211147 475 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 AC122905.1-201ENSMUST00000218181 456 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 AC158803.3-201ENSMUST00000220024 211 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Olfr202-201ENSMUST00000049859 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Vmn2r-ps100-201ENSMUST00000221238 1702 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Abca16-202ENSMUST00000120490 5088 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Olfr720-203ENSMUST00000216079 4692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Igsf10-202ENSMUST00000193455 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Vmn1r84-201ENSMUST00000086228 2452 ntAPPRIS P2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Amd1P0DMN7 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Amd1P0DMN7 Gm42583-201ENSMUST00000202678 6700 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Amd1P0DMN7 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Amd1P0DMN7 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Amd1P0DMN7 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Amd1P0DMN7 Ighv1-36-201ENSMUST00000103513 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Amd1P0DMN7 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Amd1P0DMN7 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Amd1P0DMN7 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Amd1P0DMN7 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Amd1P0DMN7 Gm12287-201ENSMUST00000119770 707 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Amd1P0DMN7 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Amd1P0DMN7 Gm13484-201ENSMUST00000120738 412 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Amd1P0DMN7 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Amd1P0DMN7 Gm24854-201ENSMUST00000158025 98 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Amd1P0DMN7 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Amd1P0DMN7 Gm23819-201ENSMUST00000158744 109 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Amd1P0DMN7 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Amd1P0DMN7 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Amd1P0DMN7 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Amd1P0DMN7 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Amd1P0DMN7 Gm27818-201ENSMUST00000184536 159 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Amd1P0DMN7 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Amd1P0DMN7 Gm28709-201ENSMUST00000186967 456 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Amd1P0DMN7 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Amd1P0DMN7 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Amd1P0DMN7 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Amd1P0DMN7 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Amd1P0DMN7 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Amd1P0DMN7 Gm43967-201ENSMUST00000203787 301 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Amd1P0DMN7 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Amd1P0DMN7 AC163621.2-201ENSMUST00000222229 682 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Amd1P0DMN7 AC165092.2-201ENSMUST00000224681 368 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Amd1P0DMN7 AC134864.1-201ENSMUST00000226326 511 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Amd1P0DMN7 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Amd1P0DMN7 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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