Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Neat1-201ENSMUST00000173672 20771 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Fat3-201ENSMUST00000082170 18456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Gm23709-201ENSMUST00000104364 130 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Gm10964-201ENSMUST00000106852 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Gm14124-201ENSMUST00000109922 3018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Kcnt2-201ENSMUST00000119786 3624 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 2210408F21Rik-202ENSMUST00000124811 384 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Vmn2r21-201ENSMUST00000163607 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Olfr723-201ENSMUST00000164157 1006 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Nutf2-ps2-201ENSMUST00000179225 384 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Gm28830-201ENSMUST00000188192 213 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 1700063I16Rik-201ENSMUST00000194611 611 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Gm36971-201ENSMUST00000195244 378 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Olfr723-202ENSMUST00000206058 1078 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Olfr1480-202ENSMUST00000207093 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Gm45261-201ENSMUST00000211023 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Klri2-201ENSMUST00000050385 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Olfr1168-201ENSMUST00000079599 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Vmn1r14-203ENSMUST00000227574 7394 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-Eb1P04230 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Cntn6-201ENSMUST00000089215 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Kcnj1-201ENSMUST00000047334 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Vmn2r26-201ENSMUST00000032238 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Olfr613-201ENSMUST00000106888 5139 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Cep290-206ENSMUST00000219765 7985 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Olfr951-202ENSMUST00000216107 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Cftr-201ENSMUST00000045706 6303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Olfr588-ps1-201ENSMUST00000118682 4607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Gm8145-201ENSMUST00000118220 745 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Gm3267-201ENSMUST00000118671 473 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Gm25103-201ENSMUST00000122671 318 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Gm16545-201ENSMUST00000161968 463 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Gm27551-201ENSMUST00000184258 77 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Gm27457-201ENSMUST00000184771 156 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Gm44603-201ENSMUST00000206820 367 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 AC166902.1-201ENSMUST00000216653 517 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 AC161114.1-201ENSMUST00000218223 474 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 AC156950.1-201ENSMUST00000219604 456 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 AC105407.3-201ENSMUST00000224161 648 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Fpr-rs7-201ENSMUST00000095637 1017 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Olfr556-202ENSMUST00000213485 3825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Gm15304-201ENSMUST00000122150 2640 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 AC139754.3-201ENSMUST00000220444 1627 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Serpinb3a-201ENSMUST00000027567 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Akap6-201ENSMUST00000095737 14847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Olfr725-202ENSMUST00000206920 1519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Pak3-204ENSMUST00000112865 8484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Olfr575-202ENSMUST00000213477 3512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 4932411K12Rik-203ENSMUST00000210384 1351 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
H2-Eb1P04230 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms