Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gm3376-201ENSMUST00000180202 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Gm20954-201ENSMUST00000189078 644 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Gm38214-201ENSMUST00000192581 988 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Gm37993-201ENSMUST00000195301 988 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Gm42458-201ENSMUST00000201914 369 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Gm18011-201ENSMUST00000203717 565 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Olfr712-ps1-201ENSMUST00000207690 950 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Gm26330-201ENSMUST00000082817 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Pnpla8-204ENSMUST00000143771 2974 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Nfat5-202ENSMUST00000077440 12773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Stard9-207ENSMUST00000180041 15102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Zfp644-203ENSMUST00000112695 1915 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 2610044O15Rik8-205ENSMUST00000190157 1776 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Olfr595-ps1-201ENSMUST00000118180 954 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Gm15120-201ENSMUST00000120602 301 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Gm13484-201ENSMUST00000120738 412 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Gm15885-201ENSMUST00000122114 388 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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H2-Q1O19441 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Mir7056-201ENSMUST00000183776 59 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Gm28873-201ENSMUST00000186130 667 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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H2-Q1O19441 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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H2-Q1O19441 Cpa3-201ENSMUST00000001921 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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H2-Q1O19441 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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H2-Q1O19441 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Gm37010-201ENSMUST00000194539 1704 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Gm7233-201ENSMUST00000168619 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Rapgef4-201ENSMUST00000028525 4109 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Mir92b-201ENSMUST00000102300 83 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Q1O19441 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.7 ms