Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm29105-201ENSMUST00000187256 450 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm28974-201ENSMUST00000187893 231 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm43685-201ENSMUST00000198876 706 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm10264-201ENSMUST00000220589 429 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 AC149586.1-201ENSMUST00000222647 645 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 A530021J07Rik-201ENSMUST00000066005 414 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Csn3-203ENSMUST00000113271 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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Rabgef1Q9JM13 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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Rabgef1Q9JM13 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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Rabgef1Q9JM13 Gm10421-203ENSMUST00000190266 781 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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Rabgef1Q9JM13 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm20304-201ENSMUST00000218168 444 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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Rabgef1Q9JM13 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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Rabgef1Q9JM13 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Ube2v2-201ENSMUST00000096234 609 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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Rabgef1Q9JM13 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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Rabgef1Q9JM13 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Olfr988-203ENSMUST00000215511 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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