Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm38041-201ENSMUST00000194445 661 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm8861-201ENSMUST00000196346 832 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm44686-201ENSMUST00000206776 540 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm2544-201ENSMUST00000222702 756 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 AC154506.3-201ENSMUST00000225417 213 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 AC122034.1-201ENSMUST00000227641 595 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm15421-201ENSMUST00000051985 443 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr1116-201ENSMUST00000090717 924 ntAPPRIS P2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm34069-201ENSMUST00000214060 2441 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm37332-201ENSMUST00000195853 2844 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm15001-201ENSMUST00000117657 795 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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RpainQ9CWY9 Gm14939-201ENSMUST00000120347 680 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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RpainQ9CWY9 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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RpainQ9CWY9 Gm13599-201ENSMUST00000134476 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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RpainQ9CWY9 Gm33819-201ENSMUST00000194008 1221 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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RpainQ9CWY9 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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RpainQ9CWY9 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 AC158521.1-201ENSMUST00000225295 660 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 CT030238.4-201ENSMUST00000228579 801 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr697-201ENSMUST00000050541 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm7099-201ENSMUST00000080066 554 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr916-201ENSMUST00000081196 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm14415-201ENSMUST00000118260 1578 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm40038-201ENSMUST00000197878 1370 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr1318-201ENSMUST00000058176 1690 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
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