Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Gm44879-201ENSMUST00000207007 503 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 AC164629.1-201ENSMUST00000220250 1113 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm23102-201ENSMUST00000083724 116 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm18189-201ENSMUST00000218153 1951 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm42986-201ENSMUST00000201618 3385 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Vmn1r184-204ENSMUST00000227534 4807 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Cdh12-203ENSMUST00000227496 6004 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm9921-201ENSMUST00000173293 4399 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Zfp287-201ENSMUST00000005399 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Prr11-201ENSMUST00000051395 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Ogt-201ENSMUST00000044475 5384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Lpar4-201ENSMUST00000060576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm12289-201ENSMUST00000130860 2235 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Mid2-203ENSMUST00000112993 5916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Olfr1217-203ENSMUST00000214022 3947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm15103-201ENSMUST00000119893 871 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm11325-201ENSMUST00000119967 469 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm14655-201ENSMUST00000120124 578 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm15791-201ENSMUST00000120365 319 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm13773-201ENSMUST00000156693 583 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm27541-201ENSMUST00000184078 122 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Snhg14-201ENSMUST00000185272 726 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm29552-201ENSMUST00000190548 660 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm18547-201ENSMUST00000192439 811 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm44523-201ENSMUST00000205616 417 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Nsa2-203ENSMUST00000225410 974 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Olfr273-201ENSMUST00000051520 1059 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Olfr1218-201ENSMUST00000099798 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Skint4-201ENSMUST00000069769 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Vmn1r219-203ENSMUST00000227388 7948 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm37268-201ENSMUST00000192254 2614 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Dnah3-201ENSMUST00000046993 12252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm19619-201ENSMUST00000200707 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Cnot4-206ENSMUST00000202143 3202 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm5746-201ENSMUST00000183550 2200 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm45223-201ENSMUST00000207037 5138 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm26248-201ENSMUST00000116700 121 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm25778-201ENSMUST00000116713 121 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm25774-201ENSMUST00000116717 121 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm22102-201ENSMUST00000116730 121 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm24193-201ENSMUST00000116801 121 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm24744-201ENSMUST00000116833 121 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm24427-201ENSMUST00000116896 121 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm22346-201ENSMUST00000116918 121 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Abcf3Q8K268 Gm23606-201ENSMUST00000116938 121 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms