Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Tmem161b-206ENSMUST00000225069 2414 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Mss51-201ENSMUST00000022353 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Neurod1-201ENSMUST00000041099 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Lrrc9-203ENSMUST00000161284 3817 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Zfp882-201ENSMUST00000110002 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 D7Ertd443e-203ENSMUST00000172947 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Grip1-215ENSMUST00000148954 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Gm36737-201ENSMUST00000209653 2189 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm13557-201ENSMUST00000120771 382 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Bambi-ps1-201ENSMUST00000121525 592 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm12648-201ENSMUST00000126270 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 6430503K07Rik-201ENSMUST00000144411 476 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm13017-201ENSMUST00000156409 400 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm24213-201ENSMUST00000158255 258 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm27288-201ENSMUST00000184215 80 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm27597-201ENSMUST00000184365 80 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm27506-201ENSMUST00000184558 80 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm27529-201ENSMUST00000184975 80 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm27907-201ENSMUST00000185101 80 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm28685-201ENSMUST00000187545 1101 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm9451-201ENSMUST00000188491 604 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm29065-201ENSMUST00000188786 487 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm16273-201ENSMUST00000202238 268 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 1700054O05Rik-201ENSMUST00000214107 555 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm35548-201ENSMUST00000214348 441 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm39465-202ENSMUST00000215177 470 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm17575-201ENSMUST00000180437 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Trpv1-202ENSMUST00000102526 3361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Ifit1bl2-202ENSMUST00000112463 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 CT025600.1-202ENSMUST00000220264 2510 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Mtbp-204ENSMUST00000169667 2570 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Musk-208ENSMUST00000179951 3376 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Ccnb1-202ENSMUST00000091295 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm37499-201ENSMUST00000194683 3478 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm17821-201ENSMUST00000223448 1693 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Plce1-201ENSMUST00000169713 9439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Itgam-202ENSMUST00000106240 3325 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Zmym5-201ENSMUST00000039812 5290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Adam18-201ENSMUST00000033957 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm44777-201ENSMUST00000205941 4052 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Trbv14-201ENSMUST00000103272 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Ighv5-6-201ENSMUST00000103446 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 0610037L13Rik-204ENSMUST00000106727 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Ghrh-202ENSMUST00000109536 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm11838-201ENSMUST00000121999 231 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
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Trim35Q8C006 Gm6921-201ENSMUST00000161478 435 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm16596-201ENSMUST00000180576 604 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm9149-201ENSMUST00000182724 1007 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm28749-204ENSMUST00000187827 571 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm8883-202ENSMUST00000188258 545 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm32569-201ENSMUST00000193955 604 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm45013-201ENSMUST00000206883 178 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 E330011O21Rik-203ENSMUST00000210555 455 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 AC132304.1-201ENSMUST00000218860 135 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 CT033781.2-201ENSMUST00000221113 153 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 AC124397.1-201ENSMUST00000224296 653 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 AC154738.3-201ENSMUST00000227953 409 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Olfr453-201ENSMUST00000053647 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Gm23039-201ENSMUST00000083870 161 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Tcf7l2-210ENSMUST00000111657 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Trim35Q8C006 1700027J07Rik-203ENSMUST00000217501 1884 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
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