Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm28047Q3US59 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Gm28047Q3US59 CT033754.1-201ENSMUST00000216941 531 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Gm28047Q3US59 Vmn1r89-201ENSMUST00000053008 951 ntAPPRIS P2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Art2b-201ENSMUST00000063920 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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