Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 AC109172.1-201ENSMUST00000227503 187 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Serbp1-201ENSMUST00000042990 15474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Vmn1r86-202ENSMUST00000226604 6378 ntAPPRIS P2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Mdc1-201ENSMUST00000082337 7335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Ighv3-1-201ENSMUST00000103478 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm13452-201ENSMUST00000120896 1097 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Eif1-ps3-201ENSMUST00000121450 342 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm22960-201ENSMUST00000122517 104 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm22940-201ENSMUST00000158560 155 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm8161-201ENSMUST00000168739 481 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm37093-201ENSMUST00000192515 407 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm43405-201ENSMUST00000198642 337 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm40323-201ENSMUST00000200649 645 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm17737-201ENSMUST00000210183 1147 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 AC152415.1-201ENSMUST00000213320 440 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Ang6-201ENSMUST00000096869 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm6486-201ENSMUST00000166202 434 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm26871-205ENSMUST00000181926 742 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
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