Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Dynlrb2-201ENSMUST00000078170 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm23815-201ENSMUST00000083231 107 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm23520-201ENSMUST00000093736 107 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm14681-201ENSMUST00000118047 411 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm16566-201ENSMUST00000160387 910 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 1700010K23Rik-201ENSMUST00000174502 376 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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Hoxd9P28357 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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Hoxd9P28357 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Ighv1-17-1-201ENSMUST00000194849 351 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm18602-201ENSMUST00000209794 851 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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Hoxd9P28357 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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Hoxd9P28357 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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Hoxd9P28357 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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Hoxd9P28357 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Vmn2r50-201ENSMUST00000074943 2586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Bsph2-201ENSMUST00000108526 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm16106-201ENSMUST00000119187 294 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Clec2f-201ENSMUST00000121051 374 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Cyp2j7-ps3-201ENSMUST00000121405 206 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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