Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 U90926-201ENSMUST00000031356 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Olfr123-201ENSMUST00000054748 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Defb9-201ENSMUST00000057076 310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Olfr1254-202ENSMUST00000111523 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Olfr812-203ENSMUST00000205013 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Gm15333-201ENSMUST00000118825 364 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Znrf1-210ENSMUST00000173781 337 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Gm24757-201ENSMUST00000176987 371 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 9330182O14Rik-201ENSMUST00000179120 423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Gm3454-201ENSMUST00000185571 412 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Gm18448-201ENSMUST00000186286 599 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 1700006F04Rik-201ENSMUST00000188582 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Gm20203-201ENSMUST00000192352 332 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Gm37817-201ENSMUST00000195276 434 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Gm43276-201ENSMUST00000199712 364 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Mir670hg-207ENSMUST00000211619 819 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Gm25147-201ENSMUST00000083030 105 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Defa-rs1P17533 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms