Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm14135-201ENSMUST00000135438 591 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm28526-201ENSMUST00000187731 419 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm37503-201ENSMUST00000192088 319 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 4930447N08Rik-201ENSMUST00000196290 497 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm43104-201ENSMUST00000197234 311 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm18127-201ENSMUST00000208479 725 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm33756-201ENSMUST00000211358 636 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 AC134860.4-201ENSMUST00000223592 978 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm9597-202ENSMUST00000227632 1387 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Abi3bp-202ENSMUST00000096012 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Olfr424-202ENSMUST00000214751 1642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Stag2-201ENSMUST00000069619 5825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 AC164297.4-201ENSMUST00000224225 1307 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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Trim12aQ99PQ1 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm11759-201ENSMUST00000121742 464 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Klra17-202ENSMUST00000122219 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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Trim12aQ99PQ1 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm9294-201ENSMUST00000165198 789 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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Trim12aQ99PQ1 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Mir6398-201ENSMUST00000184541 102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm28103-201ENSMUST00000188392 416 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Scgb1b8-ps-201ENSMUST00000189652 249 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm28137-201ENSMUST00000191478 416 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm5309-201ENSMUST00000197416 677 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Olfr712-ps1-201ENSMUST00000207690 950 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm45551-201ENSMUST00000211459 928 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 AC163646.1-201ENSMUST00000227704 397 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim12aQ99PQ1 Tas2r107-201ENSMUST00000065781 1032 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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