Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Vmn1r71-204ENSMUST00000227702 5034 ntAPPRIS P2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Gm16082-201ENSMUST00000115992 377 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Gm11790-201ENSMUST00000119569 455 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Gm15168-201ENSMUST00000121057 316 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Gm26404-201ENSMUST00000158498 109 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 0610040B10Rik-201ENSMUST00000160231 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Vmn1r139-202ENSMUST00000173668 753 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Gm27834-201ENSMUST00000183427 125 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Mir7074-201ENSMUST00000183884 63 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Mir6933-201ENSMUST00000184982 81 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Gm7128-201ENSMUST00000211639 533 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 AC157515.1-201ENSMUST00000220953 450 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Abca16-202ENSMUST00000120490 5088 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Olfr622-202ENSMUST00000213536 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Gm37244-201ENSMUST00000191748 1981 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Gm45644-201ENSMUST00000210255 2740 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Olfr676-204ENSMUST00000219602 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Trav15-1-dv6-1-201ENSMUST00000103653 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Gm14304-201ENSMUST00000117272 446 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Gm25103-201ENSMUST00000122671 318 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Gm25427-201ENSMUST00000157605 103 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Vmn1r-ps22-201ENSMUST00000176017 900 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Mir6391-201ENSMUST00000184391 104 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Gm8599-201ENSMUST00000193033 457 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Gm43428-201ENSMUST00000200108 3845 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Gm45651-201ENSMUST00000210857 335 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Rps26-ps1-202ENSMUST00000212102 351 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Vmn1r71-202ENSMUST00000226874 5194 ntAPPRIS P2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Fign-203ENSMUST00000131615 9734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Actn1Q7TPR4 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Actn1Q7TPR4 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Actn1Q7TPR4 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Actn1Q7TPR4 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Actn1Q7TPR4 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Actn1Q7TPR4 Gm11196-201ENSMUST00000119052 395 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Actn1Q7TPR4 Gm13484-201ENSMUST00000120738 412 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Actn1Q7TPR4 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Actn1Q7TPR4 Gm24113-201ENSMUST00000157477 276 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Actn1Q7TPR4 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Actn1Q7TPR4 Gm16589-201ENSMUST00000159522 918 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Actn1Q7TPR4 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.1 ms