Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm15790-201ENSMUST00000161109 1251 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm3025-201ENSMUST00000163454 489 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm3077-201ENSMUST00000165903 627 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm2878-201ENSMUST00000170173 486 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps62-201ENSMUST00000173275 910 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm22646-201ENSMUST00000175130 115 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm9569-201ENSMUST00000187492 787 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm44332-201ENSMUST00000203712 433 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 AC156504.1-201ENSMUST00000214608 157 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 AC156798.1-201ENSMUST00000220508 224 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 AC099612.2-201ENSMUST00000226824 721 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 AC192088.2-201ENSMUST00000227590 411 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Olfr16-201ENSMUST00000038432 1050 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Olfr748-201ENSMUST00000073561 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm10780-201ENSMUST00000099459 285 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 B930086L07Rik-201ENSMUST00000209529 3738 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Trappc13-205ENSMUST00000144060 3538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps100-201ENSMUST00000221238 1702 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Olfr291-202ENSMUST00000217039 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm5117-201ENSMUST00000178878 2553 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Adam26b-201ENSMUST00000080135 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm18491-201ENSMUST00000192492 1594 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Casp12-201ENSMUST00000027009 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm14991-201ENSMUST00000119913 598 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm11385-201ENSMUST00000121513 570 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gtsf1-205ENSMUST00000141364 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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Sh3bp1P55194 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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Sh3bp1P55194 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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Sh3bp1P55194 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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Sh3bp1P55194 Olfr948-201ENSMUST00000076516 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm6462-201ENSMUST00000081488 304 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm22423-201ENSMUST00000082861 184 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Olfr640-201ENSMUST00000084799 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm37767-201ENSMUST00000193239 1834 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Olfr705-202ENSMUST00000213721 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Vmn1r71-202ENSMUST00000226874 5194 ntAPPRIS P2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Zfp426-201ENSMUST00000080386 2417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Olfr1484-203ENSMUST00000215567 3699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Olfr13-202ENSMUST00000216179 3677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Olfr1484-204ENSMUST00000216014 3842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Foxr2-202ENSMUST00000163801 3072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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