Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 CT572983.1-201ENSMUST00000226895 514 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp4P35123 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Olfr1123-201ENSMUST00000054974 972 ntAPPRIS P2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm12006-201ENSMUST00000120786 403 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm13508-201ENSMUST00000121639 775 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm17177-201ENSMUST00000169144 483 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm18691-201ENSMUST00000203593 872 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Olfr1005-ps1-201ENSMUST00000216207 488 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm18228-201ENSMUST00000217297 1091 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 AC113204.1-202ENSMUST00000219846 578 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 AC079644.1-201ENSMUST00000220586 405 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 AC154329.2-201ENSMUST00000225257 383 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 AC122393.1-201ENSMUST00000226570 319 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Vmn1r236-201ENSMUST00000066998 1121 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Vmn1r43-201ENSMUST00000089418 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Olfr1037-201ENSMUST00000099911 1125 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm29730-201ENSMUST00000192986 1396 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm11260-201ENSMUST00000121163 942 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm11759-201ENSMUST00000121742 464 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp4P35123 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Vmn1r-ps22-201ENSMUST00000176017 900 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms