Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Olfr1498-ps1-201ENSMUST00000208721 991 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Gstz1-204ENSMUST00000222222 724 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtpraP18052 CT030182.2-201ENSMUST00000223569 620 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PtpraP18052 AC160962.1-203ENSMUST00000225167 1105 ntAPPRIS P5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Olfr1123-201ENSMUST00000054974 972 ntAPPRIS P2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtpraP18052 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtpraP18052 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Vmn1r49-202ENSMUST00000203791 1356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Gm14399-203ENSMUST00000109059 703 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Gm13508-201ENSMUST00000121639 775 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Gm22312-201ENSMUST00000158005 130 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Ranbp2-ps8-201ENSMUST00000183723 345 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Gm18406-201ENSMUST00000185872 669 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Gm28414-201ENSMUST00000190111 294 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 AC113204.1-202ENSMUST00000219846 578 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 AC124549.1-201ENSMUST00000225912 333 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Gm12103-201ENSMUST00000121892 362 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Prlr-212ENSMUST00000148257 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtpraP18052 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Gm13985-201ENSMUST00000154409 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Gm15812-201ENSMUST00000162331 748 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PtpraP18052 1810064F22Rik-202ENSMUST00000187399 630 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Gm21006-201ENSMUST00000196930 667 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Gm43140-201ENSMUST00000197317 456 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PtpraP18052 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtpraP18052 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PtpraP18052 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PtpraP18052 CT010486.1-201ENSMUST00000224609 422 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PtpraP18052 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PtpraP18052 Magea4-201ENSMUST00000048675 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.4 ms