Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm13058-201ENSMUST00000117097 1435 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Rbbp6-203ENSMUST00000098062 6345 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Olfr1257-202ENSMUST00000111519 2756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm24581-201ENSMUST00000103962 133 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm25713-201ENSMUST00000158625 109 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm24224-201ENSMUST00000158828 258 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Zfp456-202ENSMUST00000172266 679 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm26824-201ENSMUST00000180506 1164 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm27976-201ENSMUST00000183635 162 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Mir6537-201ENSMUST00000184150 110 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm45458-201ENSMUST00000209900 522 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Olfr918-201ENSMUST00000055099 978 ntAPPRIS P2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Olfr338-202ENSMUST00000091006 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Olfr560-201ENSMUST00000210453 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Bmp15-201ENSMUST00000024049 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm37696-201ENSMUST00000194223 3349 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Olfr13-202ENSMUST00000216179 3677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Mnat1-202ENSMUST00000187549 3688 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm25169-201ENSMUST00000104190 129 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm12704-201ENSMUST00000119789 464 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm6650-201ENSMUST00000166710 614 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm28471-201ENSMUST00000185994 615 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm8498-201ENSMUST00000188227 974 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm37881-201ENSMUST00000193001 421 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm37505-201ENSMUST00000195670 461 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm43828-201ENSMUST00000196890 639 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm17780-201ENSMUST00000207142 612 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm45507-201ENSMUST00000210611 519 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 AC122448.1-201ENSMUST00000226317 772 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Olfr957-201ENSMUST00000051653 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 n-R5s162-201ENSMUST00000082581 119 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Btbd35f17-201ENSMUST00000105014 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Btbd35f28-201ENSMUST00000105015 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Btbd35f18-201ENSMUST00000105019 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Btbd35f11-201ENSMUST00000105020 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm42549-201ENSMUST00000202392 7004 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm16892-201ENSMUST00000180999 1726 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Igkv14-111-201ENSMUST00000103320 368 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm10552-201ENSMUST00000113396 372 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
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Col5a3Q9JLI2 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm43645-201ENSMUST00000200129 341 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Nasp-ps1-201ENSMUST00000205050 691 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Olfr510-203ENSMUST00000216331 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm6645-201ENSMUST00000118505 2726 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Ifit2-201ENSMUST00000102826 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm43266-201ENSMUST00000201049 1771 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm15128-202ENSMUST00000178833 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Igkv8-19-201ENSMUST00000103389 305 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm8666-201ENSMUST00000117517 292 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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