Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm16318-201ENSMUST00000162402 601 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm17060-201ENSMUST00000172394 824 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Mir6418-201ENSMUST00000185075 115 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm29556-201ENSMUST00000187591 696 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 2810025M15Rik-203ENSMUST00000189791 251 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm17820-201ENSMUST00000220213 1068 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 AC164297.5-201ENSMUST00000224365 198 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Nsa2-203ENSMUST00000225410 974 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 AC122937.1-201ENSMUST00000226405 793 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Olfr986-201ENSMUST00000062229 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 4930504O13Rik-201ENSMUST00000064614 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Olfr996-201ENSMUST00000077075 1068 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Rpl21-ps14-201ENSMUST00000080279 483 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Olfr877-201ENSMUST00000086063 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Polk-205ENSMUST00000221899 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm15518-201ENSMUST00000127115 2108 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm43886-201ENSMUST00000205039 2386 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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Hoxc12Q8K5B8 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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Hoxc12Q8K5B8 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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Hoxc12Q8K5B8 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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