Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Hspe1-ps6-201ENSMUST00000120275 283 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Rps10-ps3-201ENSMUST00000122317 500 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Gm22312-201ENSMUST00000158005 130 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Gm25865-201ENSMUST00000158247 104 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Gm3182-202ENSMUST00000169364 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 C530043A13Rik-201ENSMUST00000186453 550 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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Usp27Q8CEG8 Gm43005-201ENSMUST00000199015 648 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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Usp27Q8CEG8 Gm42990-201ENSMUST00000199231 312 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Gm9038-201ENSMUST00000203400 604 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Hypm-201ENSMUST00000044987 581 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Gm43668-201ENSMUST00000197014 5342 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Gm37747-201ENSMUST00000193717 4003 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Gm37831-201ENSMUST00000191685 1787 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Nxf3-201ENSMUST00000080929 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Hmcn1-201ENSMUST00000074783 17908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Gm35191-201ENSMUST00000200925 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Gm43010-201ENSMUST00000195993 2878 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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Usp27Q8CEG8 Olfr535-207ENSMUST00000217235 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Usp9x-201ENSMUST00000089302 11887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Znrd1-201ENSMUST00000113669 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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Usp27Q8CEG8 Gm16060-201ENSMUST00000153140 478 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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Usp27Q8CEG8 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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Usp27Q8CEG8 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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Usp27Q8CEG8 Ankrd31-201ENSMUST00000207464 5146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 AC155805.1-201ENSMUST00000222419 3808 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Olfr556-203ENSMUST00000217526 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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Usp27Q8CEG8 Sema3a-201ENSMUST00000030714 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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Usp27Q8CEG8 Gm23534-201ENSMUST00000157539 97 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 9130024F11Rik-203ENSMUST00000187858 447 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Gm42459-201ENSMUST00000199679 742 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Usp27Q8CEG8 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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