Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Rbp7-201ENSMUST00000030848 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Olfr768-201ENSMUST00000063031 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm23300-201ENSMUST00000082712 125 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1407-ps1-201ENSMUST00000085885 797 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s152-201ENSMUST00000093641 119 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r66-201ENSMUST00000060374 1524 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Abca5-201ENSMUST00000043961 8231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Olfr615-202ENSMUST00000214345 3403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Cfhr1-201ENSMUST00000023965 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Spag17-204ENSMUST00000164539 7862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1318-201ENSMUST00000058176 1690 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 4932415D10Rik-202ENSMUST00000217661 15111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm44321-201ENSMUST00000204262 2855 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Igkv10-94-201ENSMUST00000103330 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm22472-201ENSMUST00000104115 134 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm13664-201ENSMUST00000117304 345 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm13737-201ENSMUST00000119793 232 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm14725-201ENSMUST00000120324 828 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm21960-201ENSMUST00000181924 452 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm27254-201ENSMUST00000183926 517 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm44649-201ENSMUST00000205608 364 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm8556-201ENSMUST00000210437 664 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 AC154374.1-201ENSMUST00000215351 351 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm5176-201ENSMUST00000218244 1227 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Erh-204ENSMUST00000218364 665 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 CT009711.3-201ENSMUST00000225882 250 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Olfr186-201ENSMUST00000062380 1005 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Rpl21-ps14-201ENSMUST00000080279 483 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm25140-201ENSMUST00000083254 140 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 4930567H17Rik-201ENSMUST00000092405 840 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r35-201ENSMUST00000169683 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Igf1-202ENSMUST00000095360 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Jmjd1c-206ENSMUST00000173689 8609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Cul4b-203ENSMUST00000115118 3344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Txndc9-204ENSMUST00000193832 3472 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Olfr822-202ENSMUST00000216879 2663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Syne2-201ENSMUST00000044217 21690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Xrn1-202ENSMUST00000185633 10256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm44078-201ENSMUST00000204652 2646 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Olfr824-202ENSMUST00000214192 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm11912-201ENSMUST00000117235 264 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Rpl27-ps2-201ENSMUST00000120378 399 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm15926-201ENSMUST00000120492 550 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm13932-201ENSMUST00000120873 610 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 5730412P04Rik-201ENSMUST00000147100 1149 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm22819-201ENSMUST00000157445 303 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm24940-201ENSMUST00000158326 108 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Mir6938-201ENSMUST00000184173 63 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
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