Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Khdrbs2-202ENSMUST00000185666 543 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm35041-201ENSMUST00000219581 602 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 AC164567.4-201ENSMUST00000219708 483 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Olfr339-201ENSMUST00000071437 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Btbd35f4-201ENSMUST00000105011 1491 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm336-201ENSMUST00000186376 1480 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 4930473O22Rik-201ENSMUST00000218283 1465 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Usp48Q3V0C5 1700034E13Rik-202ENSMUST00000118724 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Usp48Q3V0C5 Gm15892-201ENSMUST00000152627 439 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Usp48Q3V0C5 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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Usp48Q3V0C5 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Usp48Q3V0C5 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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Usp48Q3V0C5 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Usp48Q3V0C5 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 A530064N14Rik-201ENSMUST00000195338 1492 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Traj40-201ENSMUST00000103702 61 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Spin2-ps4-201ENSMUST00000126395 762 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Spin2-ps3-201ENSMUST00000148147 762 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm17467-201ENSMUST00000178553 468 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
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